氨基酸定点突变
生物学家劳伦斯·赫斯特和斯蒂芬·弗里兰在20世纪90年代末把天然基因密码和计算机随机产生的几百万组密码拿去比对,结果轰动一时。他们想知道,如果发生点突变这种把一个字母换掉的变异,哪一套密码系统能保留最多正确的氨基酸,或将它代换成另一个性质相似的氨基酸。
结果他们发现,天然的基因密码最经得起突变的考验。点突变常常不会影响氨基酸序列,而如果突变真的改变了氨基酸,也会由另一个物理特性相似的氨基酸来取代。据此,赫斯特与弗里兰宣称,天然的遗传密码比成千上万套随机产生的密码要优良得多。它不但不是大自然密码学家愚蠢而盲目的作品,而是万里挑一的密码系统。
天然的三联基因密码的第一个字母都有特定的对应方式。举例来说,所有以丙酮酸为前体合成的氨基酸,它们密码的第一个字母都是T。所有由α-酮戊二酸所合成的氨基酸,其三联密码第一个字母都是C;所有由草酰乙酸合成的氨基酸,第一个字母都是A;最后,几种简单前体通过单一步骤所合成的氨基酸,第一个字母都是G。
三联密码的第二个字母和氨基酸是否容易溶于水有关,或者说和氨基酸的疏水性有关。亲水性氨基酸会溶于水,疏水性氨基酸不会溶于水,但会溶在脂肪或油里,比如溶在含有脂质的细胞膜里。所有的氨基酸,可以从“非常疏水”到“非常亲水”排列成一张图谱,而正是这张图谱决定了氨基酸与第二个密码字母之间的关系。疏水性最强的六个氨基酸里有五个,第二个字母都是T,所有亲水性最强的氨基酸第二个字母都是A。介于中间的有些是G有些是C。
三联密码的第三个字母不含任何信息,不管接上哪一个字母都没关系,这组密码子都会翻译出一样的氨基酸。以甘氨酸为例,它的密码子是GGG,但是最后一个G可以代换成T、A或C。
第三个字母的随机性暗示了一些有趣的事情。二联密码可以编码16种氨基酸。如果我们从20个氨基酸里拿掉5个结构最复杂的(剩下15个氨基酸,再加上一个终止密码子)这样前两个字母与这15个氨基酸特性之间的关联就更明显了。因此,最原始的密码可能只是二联密码,后来才靠“密码子捕捉”的方式成为三联密码,也就是各氨基酸彼此竞争第三个字母。
第一个字母和氨基酸前体之间的关系直截了当,第二个字母和氨基酸的疏水性相关,第三个字母可以随机选择。这套密码系统除了可以忍受突变,还可以降低灾难发生时造成的损失,同时可以加快进化的脚步。因为如果突变不是灾难性的,那应该会带来更多的好处。
又一地检出奥密克戎变异株 甘肃疾控发出疫情防控提醒
又一地检出奥密克戎变异株 甘肃疾控发出疫情防控提醒
每日甘肃网12月20日讯 据兰州晚报报道 针对湖南省长沙市近日检出新冠病毒奥密克戎变异株,12月19日,甘肃省疾病预防控制中心发出疫情防控提醒。
湖南疾病预防控制中心18日对外发布,该中心对12月16日长沙市境外输入新冠病毒感染者呼吸道标本进行新冠病毒全基因组测序和序列分析,经中国疾病预防控制中心复核,均确认检出新冠病毒奥密克戎变异株(B.1.1.529进化分支)。该2例新冠病毒奥密克戎变异株感染者系入境闭环管控人员,目前在定点医院隔离治疗。
甘肃省疾病预防控制中心提醒公众坚持做好个人防护佩戴口罩、开窗通风、保持手清洁、对着肘部或纸巾咳嗽或打喷嚏。公共场所保持一米距离。避免去通风不良或拥挤的地方。
①每天做好自我健康监测,如有疑似新冠肺炎症状,例如发热、咳嗽、呼吸短促等症状出现时,及时监测体温,主动就诊。
②非必要不出境。短短数日,奥密克戎变异毒株已经波及多个国家和地区。减少不必要的出境旅行,就是减少感染奥密克戎变异株的机会。
③积极接种新冠疫苗。接种新冠病毒疫苗是预防控制新冠肺炎传播的最经济、最有效的措施。尚未接种新冠病毒疫苗的居民,请尽快按程序完成疫苗接种,携手共筑全民免疫屏障。
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问题一 我国现有的防控措施对奥密克戎变异株有效吗?
我国的“外防输入,内防反弹”防控策略对防范奥密克戎变异株仍然有效。奥密克戎变异株的突变位点,不影响我国主流核酸检测试剂的敏感性和特异性。我国已针对奥密克戎变异株设计建立了特异性核酸检测方法,可持续针对可能的输入病例开展病毒全基因组序列测定。
问题二 新冠疫苗可以应对奥密克戎变异株吗?
“奥密克戎”仍然属于新冠病毒,虽然它的氨基酸累加突变,但是疫苗仍然有效,可以降低重症和死亡的比例,它不可能完全突破免疫屏障,因为除了抗体免疫外,还有T细胞免疫,并且我们国家有多种疫苗免疫技术路线上市,包括灭活疫苗、蛋白苗、载体腺病毒疫苗,还有加强针,之后中国还有二代苗的研制。
兰州日报社全媒体记者 田小东
又一地检出奥密克戎变异株 甘肃疾控发出疫情防控提醒
接种疫苗
奥密克戎仍属新冠病毒,虽然它的氨基酸累加突变,但疫苗仍
有效,可低重症和死亡率。应对奥密克戎变异株,我国已经做好了多条技术路线的前期技术储备和研究,部分企业相关前期设计已开始。
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